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制備色譜柱金屬殘留量較低低，使得鍵合率增加，游離的硅羥基減少，假如還要更保險，從活動相開端進入體系內部的時分，就要留意雜質的去除，更多時分，總是會呈現一些”奇奇怪怪”的峰型，比方峰拖尾、峰前延、倒峰、寬峰等。

它是中草藥中最重要也最具有價值的生物活性成分之一，生物堿可分為59種，它們的結構比較復雜，用傳統的方法分離效果不佳，高效液相色譜法還沒呈現之前，關于生物堿的分離純化一直是學者們的難題，可是，即便使用液相色譜法分離。

也會存在許多問題，堿性化合物剖析中最顯著的難題是峰形拖尾，而且堿性越強的時分，為什么會呈現這樣的情況呢？要針對不同的峰型來具體剖析，調節活動相也能夠改善峰拖尾的現象，前期在挑選活動相的時分，要考慮活動相pH值的范圍，對堿性化合物來說，活動相的pH值對峰形會有較大影響，而且對保留因子和挑選性也有很大影響，在設定挑選樣品剖析的HPLC方法時，首先需求依據化合物的分子量巨細，極性巨細等因素挑選適宜的分離形式，在適當的分離形式下去挑選適宜的色譜柱及活動相。